Si ce vendredi 10 juillet signe à la fois la fin de l’état d’urgence sanitaire et le premier week-end de grand départ en vacances, le dernier bilan épidémiologique de Santé Publique France rappelle que le risque d’une deuxième vague de Covid-19 est bien probable. Alors que le directeur général de la santé Jérôme Salomon et le président du conseil scientifique Jean-François Delfraissy ont insisté chacun dans la presse sur la nécessité de respecter les gestes barrières, le taux de reproduction (ou R effectif) s’est envolé durant les sept jours glissants du 28 juin au 4 juillet. Celui-ci a franchi significativement le seuil de 1 dans les Pays-de-la-Loire (1,52), en Nouvelle-Aquitaine (1,32), et en Provence-Alpes-Côte d’Azur (1,24). Le R effectif est aussi égal ou légèrement supérieur à 1 en Normandie (1), dans les Hauts-de-France (1,06), en Île-de-France (1,06) et en Bretagne (1,07). La moyenne de la France métropolitaine est en aussi en hausse : elle s’établit à 1,05, alors qu’elle était stabilisée autour de 0,90 ces dernières semaines.
Passez votre doigt ou votre souris sur la région de votre choix
Pour rappel, le taux de reproduction est un des quatre indicateurs épidémiologiques - avec les taux de positivité, d’incidence et d’occupation de lits de réanimation - scrutés par les autorités sanitaires afin de déterminer si une région ou un département doit passer en zone orange ou verte. Il indique le nombre de personnes que contamine un individu infecté par le Covid-19. "S'il est supérieur à 1, cela veut dire que chaque porteur du virus va le transmettre à plus d'une personne et donc l'épidémie augmente”, a expliqué le ministre des Solidarités et de la Santé Olivier Véran lors de la présentation de la deuxième phase du déconfinement. Lorsque le R est inférieur à 1, on peut alors considérer que l'épidémie régresse. Quand le facteur de reproduction franchit ce seuil, cela signifie que des clusters (foyers épidémiques) se sont formés, et qu’ils sont en cours d’investigation. Depuis le 9 mai, 333 clusters sont apparus en France, dont 313 en métropole et 20 dans les régions et départements d’outre-mer.

68 foyers épidémiques en cours d’investigation

Si le nombre de foyers épidémiques en cours d’investigation est en baisse depuis le précédent point épidémiologique de Santé Publique France, les clusters apparaissent dans des zones géographiques jusqu’ici relativement épargnées. Comme en Nouvelle-Aquitaine, où trois foyers épidémiques se sont formés en Corrèze, en Gironde et dans les Landes selon le point de situation du 8 juillet publié par l’Agence régionale de santé (ARS). Cela signifie qu’au moins trois cas de Covid-19 regroupés ont été identifiés.
Dans les Pays-de-la-Loire en revanche, plusieurs foyers épidémiques avaient déjà été déclarés dans la Sarthe, en Mayenne, dans le Maine-et-Loire et la Loire-Atlantique lors du précédent point épidémiologique de Santé Publique France. Les choses se sont surtout corsées en Mayenne où deux nouveaux clusters s’ajoutent aux trois existants et toujours en cours d’investigation. Ce qui explique en partie que le facteur de reproduction ait bondi dans la région, passant de 0,83 à 1,52. Même cas de figure dans la région Provence-Alpes-Côte d’Azur, où un nouveau cluster apparu dans le Var vient s’ajouter à ceux déjà identifiés dans les Bouches-du-Rhône et le Vaucluse. Le taux de reproduction de l’épidémie a significativement augmenté puisqu’il est passé de seulement 0,60 à 1,24.
La vigilance reste de mise dans les Outre-mer, notamment en Guyane et à Mayotte, même si leur R effectif continue de diminuer. En Guyane, celui-ci demeure encore supérieur à 1 puisqu’il s’établit à 1,14. Le taux de reproduction a baissé jusqu’à 0,76 à Mayotte. Pour autant, Santé Publique France estime que la circulation du Sars-CoV-2 est maintenue à un niveau élevé à Mayotte et qu’elle s’accroît encore en Guyane avec une diffusion communautaire. 15 foyers épidémiques ont été identifiés dans ce département d’outre-mer depuis le 9 mai.